Hammarby IF Innebandyförening startades i april år 1993 av Ari Juustovaara. Han lämnade senare föreningen, men blir för alltid ihågkommen som grundaren av Hammarby IF Innebandy.
År 1998 bildades en fristående sektion i alliansföreningen Hammarby IF. Föreningen startade med ett herrlag säsongen 1993/94 och redan säsongen efter startade damerna sin verksamhet med spel i div 4. En stor ungdomsverksamhet har också arbetats upp med åren.
Gabriel Isoz blev ordförande 1998 och bidrog till klubbens utvecklingen under flera decennier. Han kommer alltid förknippas med Hammarby Innebandy för sin stora passion och hjärta för både sporten och föreningen.